灭鼠方法很多，一般可分为物理学灭鼠，化学灭鼠，生物学灭鼠和生态学灭鼠。
（1）物理学灭鼠法又称器械灭鼠法，它不公包括各种专用捕鼠器，如鼠夹、鼠笼、也包括压、卡、关、夹、翻、灌、挖、粘和枪击等。物理学灭鼠也讲究一定的的科学技术，如安放鼠笼（夹）要放在鼠洞口，应与鼠洞有一定距离，有时用些伪装，可以提高捕杀率；鼠笼上的诱饵要新鲜，应是鼠类爱吃的食物。
（2）化学灭鼠法又称药物灭鼠法，是应用好广，效果好好的一种灭鼠方法。药物灭鼠又可分为肠毒物灭鼠和熏蒸灭鼠。胃肠道灭鼠药多为各种毒饵，效果好，用法简便，用量大。其次是毒水、毒粉、毒胶、毒沫等。熏蒸灭鼠，如磷化铝可用于仓库、轮船熏蒸灭鼠。
（3）生物学灭鼠法包括两个方面：一是利用天敌灭鼠，主要是食肉目的小兽：如黄鼬、野猫、家猫、狐等和鸟类中的猛禽，如鹰、猫头鹰等和蛇类。一是利用对人、畜无毒而对鼠有致病力的病源微生物灭鼠。
（4）生态学灭鼠：就是通过改良环境，包括防鼠建筑、断绝鼠粮、农田改造、搞好室内外环境卫生，清除鼠类隐蔽处所。也就是控制、改造、破坏有利于鼠类生存的生活环境和条件，使鼠类不能在那些地方顺利生存和繁衍。生态学灭鼠是综合鼠害防治中很重要的一环